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嘀嘀嘀嘀,嘀嘀嘀嘀,从XX医院胎儿医学中心机要室传出一阵阵急促的电报声,8平方米的小房间内,十多号人都紧张的屏住呼吸,焦急地等待电波那头传回的声音。
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”啪“,一个标准的立正加敬礼,译码员眼含泪花,轻轻地放下手中的密码本,将译出的电文颤抖着递交给了主任,激动的语无伦次,”他,他,他,回电了“
有侦探潜能的和有怀旧情怀的同道,请自行破译电波术原文
现在的业内环境,商业化气息有点浓。听说见一回少森寺的师兄们都得挂专家号了,也就老衲还在这里自娱自嗨地嘚吧嘚。这年头,开个小店不易呀。章博,贵号好久没开张了,撑住呀。小店寒破,测字算卦解众惑。明镜非台,心本无物尘埃落。
上海的基因侦探和基因游侠一直是老衲膜拜的偶像,两位大探长的实力那是杠杠的,业内编号一个拿摩温,一个那可不是白给的。老衲灵狗狗()的编号也还算得过去,好歹挤进全国一百强。
“Sir,灵狗狗前来报到,请将案情简要的详细描述一下......”
现场勘探:
一孕妇,孕23+周,单胎,自然受孕,因不良生育史行基因芯片和染色体检测。结果提示:18号染色体长臂q22.3-q23区域存在7.4Mb左右的重复;在X染色体长臂q28区域存在8.0Mb左右的缺失。羊水染色体核型结果发现胎儿的一条X染色体存在结构问题,18号染色体多出的片段接在了X染色体缺失的部位,也就是46,X,der(X)t(X;18)(q28;q22.3),胎儿超声检测没有发现任何异常。
遗传密探现场办案:
18号染色体上重复片段和X染色体上的缺失片段,从专业术语来说,俺们称之为CNV。经现场分析,这两个CNV均位于染色体末端,18q22.3q23重复部分接至Xq28缺失部分形成一条衍生染色体。基因芯片可以检测到CNV在染色体上具体的位置。对这个病例的两个CNV,位置如下chr18(-);chrX(-)。
案件分析现场意见:
有人认为,两个非常大片段的异常,18号染色体多了一大段,X染色体少了一大段很关键的部分,涉及基因较多,虽然胎儿超声目前没有发现问题,但总体来说风险很高,胎儿出问题的概率较大。
选择题:您是否认可这个观点
A同意B不同意
对CNV的遗传分析
1.对CNV性质的分类
对arr[hg19]Xq28(-)X1的分析,缺失片段大小8.01Mb,涵盖基因个,其中蛋白编码基因个,OMIM收录基因个,OMIM致病基因36个,Clingen已分析过的基因19个,其中涉及单倍基因不足剂量敏感基因10多个(Haploinsufficiencyscore3)。通过ClinGenCNVPathogenicityCalculator评估,该CNV为致病性CNV(评分1.9分)
对arr[hg19]18q22.3q23(-)X3的分析,重复片段大小7.38Mb,涵盖基因52个,其中蛋白编码基因26个,OMIM收录基因20个,OMIM致病基因4个,Clingen已分析过的基因4个,其中涉及三倍基因剂量敏感基因0个。通过ClinGenCNVPathogenicityCalculator评估,该CNV为不确定CNV(评分-0.89,0.9分).
2.这个致病性CNV一定会导致胎儿出现问题吗
做过遗传咨询的同道对这个问题会深有感触,因为对前来咨询者而言,人家看不懂也听不懂这么多专业的条条框框,千言万语就一句话,哥,您就告诉我,胎儿有问题不,能要不?
其实,论遗传咨询师的自我修养一书对这个问题早有操作规范说明,要还是不要,真不该是遗传咨询师回答的问题。我们所能做的,就是帮助咨询者更多地、尽可能全面地了解相关知识。
首先对Xq28缺失CNV内OMIM致病基因的分析,这个区域内涉及单倍量不足的基因有AFF2,IDS,NSDHL,SLC6A8,L1CAM,AVPR2,MECP2,FLNA,IKBKG,F8等。乍一看真的挺吓人的。致病性评级肯定是没有问题的,但其实,仔细对每个基因进行分析会发现,很多基因的致病方式是X连锁隐性遗传,也就是说,从理论上来说,女胎就算一条X出了问题,也不会得病。对X连锁显性遗传基因分析,可能涉及CHILD综合征(导致先天性半发育不全伴鱼鳞状红细胞水肿和肢体缺损)或X-连锁显性色素失禁症等疾病,但仔细分析可以发现,大部分基因导致的功能丧失(lossoffunction)是点突变或基因内的小缺失,整个基因甚至更大片段的缺失导致的lossoffunction的单倍剂量不足目前文献没有查到。
在这个大CNV中,有一个基因特别引起我们注意,MECP2,这个基因查询clingen网站(